डूम 2डी में अंतरिक्ष लैंडिंग बल को मंगल ग्रह पर भेजा गया था, जहां यूनाइटेड स्पेस कॉर्पोरेशन के स्वामित्व वाला एक परिसर स्थित है। नर्क में गुप्त अनुसंधान वहाँ हुआ। प्रयोगशाला एक पोर्टल पर बनाई गई थी जिसे एक बार खोजा गया था और वैज्ञानिकों ने इसका अध्ययन करना शुरू कर दिया था और मानवता के लाभ के लिए इसका उपयोग करने की संभावना थी। अंत में, सब कुछ योजना के अनुसार बिल्कुल भी नहीं हुआ। राक्षसों ने पोर्टल से बाहर निकलकर उपनिवेशवादियों पर हमला कर दिया। पैराट्रूपर को हार्ड ड्राइव पर गुप्त अनुसंधान फ़ाइलों को पुनः प्राप्त करना होगा और जो जीवित बचे हैं उन्हें बचाना होगा। उसकी मदद करें, उसे डूम 2डी में राक्षसी प्राणियों से लड़ते हुए परिसर में घूमना होगा।
