पक्षी प्रवास गर्म क्षेत्रों में पक्षियों का वार्षिक प्रवास है। एक बार जब शरद ऋतु आती है, तो कई पक्षी प्रजातियाँ ठंडी सर्दियों से बचने के लिए दक्षिण की ओर चली जाती हैं। बत्तखें उनमें से एक हैं, और खेल में आप एक बत्तख को कठिन उड़ान से उबरने में मदद करेंगे। लेकिन सबसे पहले आपको खेल में प्रस्तुत नायकों में से एक चरित्र चुनना होगा: पाम, मैक, अंकल डैन, ग्वेन और डैक्स। उनमें से कोई भी आपके नियंत्रण का पालन करेगा. माइग्रेशन फ्लैपी डक का कथानक यह है कि आपका पक्षी झुंड के पीछे पड़ गया है। जब उसके सभी रिश्तेदार उड़ गए, तो उसका पंख क्षतिग्रस्त हो गया था, लेकिन अब वह ठीक हो गया है और आप झुंड को पकड़ने और एक साथ उड़ने की कोशिश कर सकते हैं। लेकिन पहले आपको बहुत सी बाधाओं को पार करना होगा और माइग्रेशन फ्लैपी डक में बिना रुके अपने पंखों को जोर-जोर से फड़फड़ाना होगा।
