நிஞ்ஜா ஹேண்ட்ஸ் 2 விளையாட்டின் இரண்டாம் பகுதியில், அவரைக் கொல்ல விரும்பும் பல்வேறு எதிரிகளுக்கு எதிராக உங்கள் நிஞ்ஜா போருக்கு தொடர்ந்து உதவுவீர்கள். உங்கள் போராளி உங்களுக்கு முன்னால் உள்ள திரையில் தெரியும், அவர் ஒரு குறிப்பிட்ட இடத்தில் இருப்பார். எதிரி அவனிடமிருந்து தொலைவில் இருப்பான். கீழ் வலது மூலையில் ஐகான்களுடன் ஒரு சிறப்பு குழு இருக்கும். அவற்றைக் கிளிக் செய்வதன் மூலம், சில செயல்களைச் செய்ய ஹீரோவை கட்டாயப்படுத்தலாம். நீங்கள் உங்கள் எதிரியைத் தாக்க வேண்டும் மற்றும் எதிரியை அழிக்க உங்கள் சண்டை திறன்களைப் பயன்படுத்த வேண்டும். இதற்காக, நிஞ்ஜா ஹேண்ட்ஸ் 2 விளையாட்டில் உங்களுக்கு புள்ளிகள் வழங்கப்படும்.