सोनिक के पास अपने पुराने दुश्मन नक्कल्स से निपटने का अवसर है। ब्लू हेजहोग को अपने प्रतिद्वंद्वी के स्थान के बारे में अप्रत्याशित जानकारी मिली और वह वहां जाने का इरादा रखता है। नायक अपने मित्र और सहायक टेल्स के साथ विमान से द्वीप पर जायेंगे। उतरने के बाद, वे नक्कल्स से मिलेंगे, लेकिन वह जल्दी ही गायब हो जाएगा। आपको खलनायक का पीछा करने में सोनिक और उसके दोस्त की मदद करनी चाहिए। उसने द्वीप पर बहुत सारे जाल बिछाए ताकि कोई उसे पकड़ न सके, लेकिन सोनिक को रोका नहीं जा सकता है, और आप नायक की गति को सख्ती से नियंत्रित करेंगे, उसे तेज स्पाइक्स में भागने से रोकेंगे। अंगूठियां इकट्ठा करें, वे सोनिक 3 और नक्कल्स में नायक के लिए हमेशा उपयोगी रहेंगी।
