ऐसा प्रतीत होता है कि फ्लिप निंजा में निन्जाओं के लिए गुरुत्वाकर्षण जैसी कोई चीज़ नहीं है। वह ऊपर कूद सकता है और फिर उसी फुर्ती से नीचे गिर सकता है, हमेशा दोनों पैरों पर मजबूती से खड़ा रहता है। इसलिए, कूदना खुद उसके लिए कोई समस्या नहीं है, लेकिन अंतरिक्ष में जो है वह एक परीक्षण बन जाएगा। नुकीले शूरिकेन और अन्य छेदने और काटने वाली वस्तुएँ बाएँ और दाएँ से उड़ती हैं। आपको वह क्षण चुनना होगा जब रास्ता साफ हो और उसके बाद ही कूदें। प्रत्येक सफल छलांग के लिए आपको एक अंक मिलेगा, और यदि आप एक फल लेने में कामयाब होते हैं: लाल या हरा, तो आपको फ्लिप निंजा में एक बार में तीन अंक मिलेंगे।