मारियो, एक प्लंबर, जिसे हम सभी प्यार करते थे, पार्कौर जैसे स्ट्रीट स्पोर्ट में दिलचस्पी लेने लगा। हमारे नायक ने शहर की इमारतों की छतों पर इस खेल में खुद को प्रशिक्षित करने का फैसला किया। आप सुपर मारियो सिटी रन में उनके साथ इस कसरत में शामिल होंगे। स्क्रीन पर आपके सामने मारियो घर की छत पर खड़ा दिखाई देगा। आपके मार्गदर्शन में वह धीरे-धीरे गति पकड़कर आगे की ओर दौड़ेगा। स्क्रीन को ध्यान से देखें। आपके नायक के रास्ते में इमारतों की छतों को अलग करने में विफलताएँ होंगी। जब वह उनमें से एक के पास एक निश्चित दूरी पर दौड़ता है, तो आपको उसे कूदना होगा। इस प्रकार, आपका नायक इस खतरे से कूद जाएगा। साथ ही मारियो के सामने बाधाएं भी आएंगी। उनमें से कुछ पर, वह रन पर चढ़ने में सक्षम होगा, दूसरों के नीचे, इसके विपरीत, उसे नीचे की ओर अपनी पीठ पर ड्राइव करने की आवश्यकता होगी। रास्ते में, मारियो को विभिन्न आइटम लेने होंगे जो आपको अंक दिलाएंगे और नायक को विभिन्न प्रकार के बोनस दे सकते हैं।
