एक बहादुर निंजा लड़के को आज अपने आदेश के प्रमुख को एक रिपोर्ट देनी होगी। हमारे नायक को एक अंधेरे जंगल को दूर करने की आवश्यकता होगी जिसमें विभिन्न प्रकार के राक्षस पाए जाते हैं। आप गेम निंजा बॉय अल्टीमेट एडिशन में उसकी मदद करेंगे। आपके सामने स्क्रीन पर आप अपने चरित्र को देखेंगे, जो धीरे-धीरे गति पकड़ते हुए रास्ते में दौड़ेगा। इसके रास्ते में विभिन्न बाधाएं और जाल दिखाई देंगे। चरित्र को चतुराई से नियंत्रित करके, आप उसे दौड़ते समय उन सभी पर से छलांग लगा सकते हैं। राक्षसों से मिलने के बाद, आप उन पर शूरिकेन फेंककर या अपनी भरोसेमंद तलवार से वार करके उन्हें नष्ट कर सकते हैं। रास्ते में हर जगह बिखरी विभिन्न वस्तुओं और सिक्कों को इकट्ठा करें। आपके द्वारा उठाए गए आइटम के लिए, आपको निंजा बॉय अल्टीमेट एडिशन में अंक दिए जाएंगे।