वायरस निंजा 2 गेम के दूसरे भाग में, आप एक बहादुर निंजा योद्धा को विभिन्न वायरस से लड़ने में मदद करेंगे। इससे पहले कि आप स्क्रीन पर एक खेल का मैदान होगा जिस पर विभिन्न बैक्टीरिया दिखाई देंगे। वे अलग-अलग दिशाओं में और अलग-अलग गति से आगे बढ़ेंगे। उन्हें नष्ट करने के लिए आपको एक तलवार का उपयोग करने की आवश्यकता होगी। स्क्रीन को ध्यान से देखें और माउस से ऑब्जेक्ट को ड्राइव करें। इस प्रकार, आप बैक्टीरिया पर प्रहार करेंगे और उन्हें टुकड़ों में काट लेंगे। कभी-कभी इन वस्तुओं के बीच बम दिखाई दे सकते हैं। आपको उन्हें स्विंग नहीं करना चाहिए।
