नए निंजा बनाम निंजा गेम में, आप उस दुनिया में जाएंगे जहां बॉक्स के लोग रहते हैं। दो निंजा आदेशों के बीच एक युद्ध है और आप उनमें से एक में शामिल हो जाएंगे। आपका किरदार एक रेड बॉक्स मैन है। वह उस कमरे में होगा जहां उसका प्रतिद्वंद्वी नीला है। उनके बीच विभिन्न बाधाओं और जाल स्थित होंगे। आपको इन सभी खतरों से अपने चरित्र का मार्गदर्शन करना होगा और अपने प्रतिद्वंद्वी पर हमला करना होगा। विभिन्न फेंकने वाले हथियारों का उपयोग करके आप दुश्मन को नष्ट करते हैं और इसके लिए अंक प्राप्त करते हैं।
